Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
GFRA1P56159 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GFRA1P56159 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms