Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1LP55160 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKAP1LP55160 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1LP55160 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms