Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RARSP54136 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RARSP54136 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
RARSP54136 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RARSP54136 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RARSP54136 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RARSP54136 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARSP54136 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARSP54136 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARSP54136 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARSP54136 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARSP54136 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARSP54136 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RARSP54136 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RARSP54136 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RARSP54136 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RARSP54136 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARSP54136 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARSP54136 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARSP54136 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARSP54136 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RARSP54136 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARSP54136 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RARSP54136 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms