Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOSBP53539 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOSBP53539 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOSBP53539 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOSBP53539 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOSBP53539 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOSBP53539 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOSBP53539 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOSBP53539 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOSBP53539 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOSBP53539 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOSBP53539 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOSBP53539 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOSBP53539 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOSBP53539 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOSBP53539 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOSBP53539 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOSBP53539 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOSBP53539 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOSBP53539 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOSBP53539 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOSBP53539 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOSBP53539 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOSBP53539 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOSBP53539 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOSBP53539 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOSBP53539 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOSBP53539 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOSBP53539 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOSBP53539 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOSBP53539 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms