Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF2A1P52655 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A1P52655 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms