Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK3P51956 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK3P51956 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK3P51956 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK3P51956 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK3P51956 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK3P51956 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK3P51956 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK3P51956 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEK3P51956 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEK3P51956 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEK3P51956 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK3P51956 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK3P51956 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK3P51956 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEK3P51956 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEK3P51956 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK3P51956 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK3P51956 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK3P51956 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK3P51956 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK3P51956 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK3P51956 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK3P51956 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEK3P51956 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEK3P51956 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEK3P51956 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEK3P51956 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms