Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX1P48742 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX1P48742 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX1P48742 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX1P48742 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX1P48742 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LHX1P48742 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX1P48742 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX1P48742 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX1P48742 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX1P48742 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX1P48742 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX1P48742 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX1P48742 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX1P48742 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX1P48742 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX1P48742 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX1P48742 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX1P48742 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX1P48742 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX1P48742 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX1P48742 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX1P48742 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX1P48742 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX1P48742 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX1P48742 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX1P48742 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX1P48742 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX1P48742 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms