Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1DP48730 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms