Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTDSS1P48651 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTDSS1P48651 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTDSS1P48651 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTDSS1P48651 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTDSS1P48651 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS1P48651 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS1P48651 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS1P48651 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS1P48651 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS1P48651 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS1P48651 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTDSS1P48651 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS1P48651 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS1P48651 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS1P48651 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS1P48651 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS1P48651 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS1P48651 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS1P48651 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTDSS1P48651 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTDSS1P48651 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTDSS1P48651 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS1P48651 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS1P48651 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS1P48651 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS1P48651 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS1P48651 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS1P48651 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTDSS1P48651 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms