Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RXRGP48443 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RXRGP48443 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRGP48443 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRGP48443 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRGP48443 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRGP48443 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRGP48443 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRGP48443 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RXRGP48443 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RXRGP48443 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RXRGP48443 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RXRGP48443 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXRGP48443 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXRGP48443 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXRGP48443 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXRGP48443 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXRGP48443 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXRGP48443 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXRGP48443 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RXRGP48443 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RXRGP48443 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RXRGP48443 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RXRGP48443 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms