Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTTP42858 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTTP42858 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTTP42858 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTTP42858 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTTP42858 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTTP42858 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTTP42858 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTTP42858 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTTP42858 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTTP42858 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTTP42858 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTTP42858 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTTP42858 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTTP42858 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HTTP42858 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTTP42858 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTTP42858 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTTP42858 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTTP42858 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTTP42858 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTTP42858 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTTP42858 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTTP42858 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTTP42858 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTTP42858 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTTP42858 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTTP42858 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTTP42858 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTTP42858 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTTP42858 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTTP42858 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTTP42858 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HTTP42858 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms