Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CASP2P42575 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CASP2P42575 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CASP2P42575 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASP2P42575 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASP2P42575 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASP2P42575 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP2P42575 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASP2P42575 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP2P42575 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP2P42575 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP2P42575 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP2P42575 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP2P42575 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASP2P42575 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASP2P42575 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASP2P42575 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms