Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARL1P40616 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARL1P40616 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARL1P40616 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARL1P40616 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARL1P40616 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARL1P40616 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARL1P40616 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARL1P40616 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARL1P40616 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARL1P40616 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARL1P40616 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARL1P40616 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL1P40616 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL1P40616 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL1P40616 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL1P40616 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL1P40616 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL1P40616 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARL1P40616 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARL1P40616 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARL1P40616 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARL1P40616 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARL1P40616 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms