Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMGCLP35914 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGCLP35914 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms