Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPOP30536 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPOP30536 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPOP30536 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPOP30536 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSPOP30536 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSPOP30536 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSPOP30536 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TSPOP30536 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms