Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB6P28072 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB6P28072 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms