Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-DMAP28067 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-DMAP28067 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms