Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMLP26374 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMLP26374 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMLP26374 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMLP26374 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMLP26374 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMLP26374 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMLP26374 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMLP26374 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMLP26374 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMLP26374 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHMLP26374 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMLP26374 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMLP26374 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMLP26374 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMLP26374 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHMLP26374 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHMLP26374 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHMLP26374 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHMLP26374 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMLP26374 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMLP26374 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMLP26374 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMLP26374 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMLP26374 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMLP26374 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMLP26374 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMLP26374 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMLP26374 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHMLP26374 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMLP26374 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMLP26374 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMLP26374 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMLP26374 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMLP26374 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMLP26374 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMLP26374 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMLP26374 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMLP26374 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMLP26374 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMLP26374 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMLP26374 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMLP26374 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms