Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNE1P24864 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNE1P24864 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNE1P24864 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms