Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KDELR1P24390 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDELR1P24390 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms