Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPREP23469 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPREP23469 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPREP23469 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPREP23469 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPREP23469 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPREP23469 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPREP23469 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPREP23469 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPREP23469 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPREP23469 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPREP23469 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPREP23469 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPREP23469 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPREP23469 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPREP23469 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPREP23469 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPREP23469 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPREP23469 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPREP23469 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPREP23469 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPREP23469 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPREP23469 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPREP23469 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPREP23469 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPREP23469 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPREP23469 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPREP23469 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPREP23469 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPREP23469 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPREP23469 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPREP23469 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPREP23469 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPREP23469 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPREP23469 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPREP23469 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPREP23469 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPREP23469 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPREP23469 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPREP23469 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPREP23469 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPREP23469 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPREP23469 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPREP23469 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPREP23469 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPREP23469 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms