Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCP2P22307 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCP2P22307 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2P22307 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCP2P22307 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCP2P22307 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCP2P22307 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCP2P22307 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2P22307 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2P22307 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2P22307 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2P22307 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2P22307 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2P22307 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCP2P22307 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCP2P22307 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 488.3 ms