Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP2B1P20020 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms