Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GM2AP17900 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GM2AP17900 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GM2AP17900 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GM2AP17900 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GM2AP17900 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GM2AP17900 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GM2AP17900 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GM2AP17900 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GM2AP17900 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GM2AP17900 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GM2AP17900 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GM2AP17900 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GM2AP17900 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GM2AP17900 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GM2AP17900 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GM2AP17900 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GM2AP17900 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GM2AP17900 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GM2AP17900 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GM2AP17900 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GM2AP17900 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GM2AP17900 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GM2AP17900 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GM2AP17900 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GM2AP17900 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GM2AP17900 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GM2AP17900 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GM2AP17900 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GM2AP17900 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GM2AP17900 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1029.9 ms