Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE6AP16499 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE6AP16499 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE6AP16499 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms