Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTLA4P16410 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTLA4P16410 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms