Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GCFC2P16383 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCFC2P16383 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCFC2P16383 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms