Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM27P14373 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM27P14373 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms