Protein–RNA interactions for Protein: P13671

C6, Complement component C6, humanhuman

Predictions only

Length 934 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6P13671 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6P13671 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6P13671 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6P13671 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6P13671 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6P13671 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6P13671 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6P13671 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6P13671 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6P13671 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6P13671 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6P13671 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C6P13671 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6P13671 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6P13671 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C6P13671 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C6P13671 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6P13671 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6P13671 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6P13671 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6P13671 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6P13671 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6P13671 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6P13671 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6P13671 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6P13671 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6P13671 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C6P13671 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6P13671 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6P13671 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6P13671 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6P13671 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6P13671 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6P13671 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6P13671 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6P13671 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6P13671 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6P13671 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6P13671 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6P13671 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6P13671 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms