Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFTRP13569 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CFTRP13569 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CFTRP13569 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CFTRP13569 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CFTRP13569 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CFTRP13569 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
CFTRP13569 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CFTRP13569 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFTRP13569 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CFTRP13569 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFTRP13569 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFTRP13569 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFTRP13569 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CFTRP13569 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CFTRP13569 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CFTRP13569 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CFTRP13569 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
CFTRP13569 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFTRP13569 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFTRP13569 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFTRP13569 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFTRP13569 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFTRP13569 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFTRP13569 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFTRP13569 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFTRP13569 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFTRP13569 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFTRP13569 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFTRP13569 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFTRP13569 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFTRP13569 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFTRP13569 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFTRP13569 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFTRP13569 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFTRP13569 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFTRP13569 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFTRP13569 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFTRP13569 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFTRP13569 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CFTRP13569 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFTRP13569 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFTRP13569 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CFTRP13569 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CFTRP13569 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CFTRP13569 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CFTRP13569 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CFTRP13569 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CFTRP13569 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.79
CFTRP13569 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
CFTRP13569 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFTRP13569 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFTRP13569 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFTRP13569 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFTRP13569 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFTRP13569 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFTRP13569 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFTRP13569 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CFTRP13569 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFTRP13569 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFTRP13569 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
CFTRP13569 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFTRP13569 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFTRP13569 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFTRP13569 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFTRP13569 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
CFTRP13569 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFTRP13569 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFTRP13569 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms