Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SKIP12755 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SKIP12755 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKIP12755 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SKIP12755 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIP12755 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIP12755 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIP12755 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIP12755 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIP12755 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIP12755 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SKIP12755 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIP12755 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIP12755 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIP12755 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIP12755 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIP12755 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIP12755 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SKIP12755 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SKIP12755 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SKIP12755 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SKIP12755 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIP12755 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIP12755 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIP12755 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIP12755 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIP12755 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIP12755 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SKIP12755 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIP12755 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIP12755 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIP12755 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SKIP12755 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIP12755 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIP12755 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIP12755 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIP12755 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIP12755 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIP12755 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIP12755 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SKIP12755 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SKIP12755 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms