Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HARSP12081 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HARSP12081 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HARSP12081 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HARSP12081 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HARSP12081 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HARSP12081 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HARSP12081 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HARSP12081 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HARSP12081 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms