Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMIM10L2AP0DMW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM10L2AP0DMW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms