Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC166P0CW27 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms