Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM200BP0CF97 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM200BP0CF97 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM200BP0CF97 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms