Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB7P09629 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXB7P09629 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms