Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
TNP1P09430 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
TNP1P09430 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
TNP1P09430 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
TNP1P09430 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms