Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT7P08729 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT7P08729 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT7P08729 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT7P08729 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT7P08729 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT7P08729 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT7P08729 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT7P08729 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT7P08729 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT7P08729 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT7P08729 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT7P08729 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT7P08729 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT7P08729 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms