Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
COL3A1P02461 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
COL3A1P02461 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
COL3A1P02461 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms