Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01737 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01737 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01737 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01737 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01737 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01737 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01737 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01737 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
P01737 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01737 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01737 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01737 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01737 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01737 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01737 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01737 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01737 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01737 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms