Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P00734 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P00734 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P00734 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P00734 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P00734 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P00734 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P00734 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P00734 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P00734 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P00734 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P00734 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P00734 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
F2P00734 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F2P00734 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
F2P00734 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F2P00734 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P00734 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F2P00734 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F2P00734 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F2P00734 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
F2P00734 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F2P00734 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P00734 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
F2P00734 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms