Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYF2O95926 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SYF2O95926 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYF2O95926 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYF2O95926 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYF2O95926 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYF2O95926 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYF2O95926 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYF2O95926 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYF2O95926 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYF2O95926 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms