Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCNDBP1O95273 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms