Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF6O94906 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPF6O94906 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms