Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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SEC24DO94855 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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SEC24DO94855 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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SEC24DO94855 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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SEC24DO94855 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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SEC24DO94855 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEC24DO94855 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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SEC24DO94855 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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SEC24DO94855 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC24DO94855 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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