Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPP40O75818 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPP40O75818 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPP40O75818 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPP40O75818 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP40O75818 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP40O75818 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP40O75818 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP40O75818 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP40O75818 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP40O75818 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP40O75818 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPP40O75818 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPP40O75818 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPP40O75818 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPP40O75818 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPP40O75818 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms