Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRMUO75648 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRMUO75648 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRMUO75648 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRMUO75648 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRMUO75648 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRMUO75648 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRMUO75648 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRMUO75648 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRMUO75648 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRMUO75648 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRMUO75648 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRMUO75648 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRMUO75648 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms