Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SMARCA5O60264 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMARCA5O60264 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms