Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRICKLE3O43900 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRICKLE3O43900 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms