Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CYTH3O43739 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYTH3O43739 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms